Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd38P56528 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd38P56528 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms