Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cks2P56390 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms