Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CdaP56389 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CdaP56389 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CdaP56389 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CdaP56389 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CdaP56389 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms