Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GferP56213 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GferP56213 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GferP56213 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GferP56213 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GferP56213 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms