Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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