Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pex2P55098 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pex2P55098 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pex2P55098 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms