Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Faf1P54731 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Faf1P54731 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Faf1P54731 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms