Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad23aP54726 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms