Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh6P54276 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh6P54276 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms