Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fgf9P54130 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf9P54130 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms