Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PitpnbP53811 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms