Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PklrP53657 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PklrP53657 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PklrP53657 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PklrP53657 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PklrP53657 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PklrP53657 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PklrP53657 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PklrP53657 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PklrP53657 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms