Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms