Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna1P52793 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna1P52793 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms