Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1cP52432 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1cP52432 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms