Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr4P51680 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms