Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa-rs12P50716 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa-rs12P50716 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa-rs12P50716 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms