Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-1P50220 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms