Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc13P50207 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms