Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms