Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epb42P49222 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms