Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbp3P49194 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp3P49194 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp3P49194 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp3P49194 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp3P49194 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp3P49194 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms