Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurod6P48986 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod6P48986 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms