Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptx3P48759 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms