Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms