Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx1P48377 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms