Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms