Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VdrP48281 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VdrP48281 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VdrP48281 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VdrP48281 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VdrP48281 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms