Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms