Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13P47963 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms