Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms