Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf1P46099 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms