Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms