Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NodalP43021 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NodalP43021 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NodalP43021 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NodalP43021 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NodalP43021 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NodalP43021 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NodalP43021 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NodalP43021 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms