Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syt4P40749 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt4P40749 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms