Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd1P40201 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd1P40201 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd1P40201 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd1P40201 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd1P40201 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms