Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms