Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik2P39087 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms