Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtlP38585 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TtlP38585 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TtlP38585 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TtlP38585 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtlP38585 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms