Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms