Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PpardP35396 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpardP35396 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpardP35396 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpardP35396 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpardP35396 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpardP35396 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpardP35396 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PpardP35396 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms