Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn11P35235 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn11P35235 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms