Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc1P34928 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms