Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pola1P33609 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pola1P33609 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms