Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms