Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc10P31257 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc10P31257 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms