Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrbP28704 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrbP28704 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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