Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a9P28571 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms