Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja4P28235 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja4P28235 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms