Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb1P28230 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms